Prekogranična saradnja predstavlja okvir za ubrzane ekonomske integracije koji ima za cilj smanjivanje postojećih razlika, povećanje nivoa razvijenosti prekograničnih regiona, kao i unapređenje sveobuhvatne kulturne, socijalne i naučne saradnje između lokalnih i regionalnih zajednica.
Specifični ciljevi prekogranične saradnje su:
Razviti turizam kao ključni sektor prekogranične ekonomije
Promovisati prekograničnu saradnju u trgovini kao i pristup novim tržištima
Ponovo uspostaviti prekogranične veze između organizacija koje pružaju podršku poslovanju i trgovini kako bi zajedno promovisale inicijative za saradnju
Održati dobar kvalitet životne sredine pograničnih regiona, kao ekonomskog resursa, sarađujući u inicijativama zaštite i eksploatacije životne sredine
Jačati ekonomske i sportske veze među ljudima kako bi se ojačale međuetničke, obrazovne, kulturne i sportske veze i podjednako koristila područja od zajedničkog interesa
Obezbjeđivanje jednakih mogućnosti za sve
Uvažavanje posebnih potreba ranjivih grupa, osoba sa invaliditetom i/ili nacionalnih manjina; Zaštita životne sredine, kako prirodne, tako i one, koju je izgradio čovjek u cilju održivog razvoja
Izgradnja partnerstava i zajednički rad
U osam programa prekogranične i transnacionalne saradnje u kojima je Crna Gora učestvovala (Albanija-Crna Gora, Bosna i Hercegovina-Crna Gora, Hrvatska-Crna Gora, Srbija-Crna Gora, Crna Gora-Kosovo, IPA Jadranski program, Program Jugoistočna Evropa i Mediteranski program) ugovoreno je 227 projekata, s ukupnom vrijednošću od 37,82 miliona eura (20 miliona eura u okviru bilateralnih i 17,83 miliona eura u okviru programa sa zemljama članicama EU). Crna Gora je realizovala najveći broj bilateralnih prekograničnih projekata sa zemljama korisnicama IPA sredstava (136 projekata od ukupno 321 realizovanog projekta u regionu).